Zum Saisonstart musste die Mannschaft von Karl-Heinz Emig zum VfB Stuttgart reisen. Im ersten Spiel unterlagen die B-Junioren mit 1:3. Aber bereits in den folgenden vier Partien überzeugte der FCK-Nachwuchs mit zwei Siegen und zwei Unentschieden. Am sechsten Spieltag unterlag man zu Hause den Münchner Löwen mit 0:3 und auch im darauf folgenden Lokalderby gegen Mainz 05 konnten die B-Junioren nicht punkten. Aus den fünf verbleibenden Begegnungen der Hinrunde sammelte die Emig-Elf zehn Punkte, nur im letzten Vorrundenspiel gegen Bayern München musste man sich auf dem Fröhnerhof mit 0:2 geschlagen geben. In der Saisonhalbzeit belegte die U17 mit 24 Zählern den fünften Tabellenplatz.

Auch in die Rückrunde starteten die Kleinen Roten Teufel mit einer Niederlage gegen Stuttgart. Nach einem Sieg und einer weiteren Niederlage überzeugten die B-Junioren mit sehr guten Leistungen und einer fulminanten Serie von sieben Siegen. Dadurch spielten sie sich an die Spitzenteams heran und ließen bis drei Spieltage vor Schluss die Hoffnung auf den zweiten Tabellenplatz aufleben, der die Teilnahme am Kampf um die Deutsche Meisterschaft bedeutet hätte. Hinter Spitzenreiter Bayern München kämpften 1860, Stuttgart und der FCK um den begehrten zweiten Rang. Nach dem 1:0-Sieg gegen den SSV Ulm am 23. Spieltag rückte die U17 zwischenzeitlich sogar an die zweite Stelle. Der Nachwuchs des FCK musste dann jedoch den kräfteraubenden Spielen Tribut zollen. Am 24. Spieltag unterlag man beim abstiegsbedrohten Club aus Frankfurt mit 0:1. Den Rückschlag verdaute die junge Truppe nicht mehr. Nach einer bis dahin sehr guten Saisonleistung verlor man auch die verbleibenden zwei Partien. Am letzten Spieltag musste man beim Tabellenführer aus Bayern sogar eine 0:5 Niederlage einstecken. Nichtsdestotrotz hat die Mannschaft von Karl-Heinz Emig eine hervorragende Saison gespielt. Als Tabellenvierter beendeten die B-Junioren des 1. FC Kaiserslautern die Spielzeit 2008/09.

Vor eigenem Publikum war die U17 siebenmal siegreich, einmal trennte man sich Unentschieden, fünfmal verlor der FCK zu Hause – damit erspielte die Mannschaft von Karl-Heinz Emig im Sportpark Rote Teufel 22 Zähler. Auswärts kam die U17 mit acht Siegen, zwei Unentschieden und nur drei Niederlagen sogar auf 26 Punkte.

Von den 56 Treffern, die der FCK-Nachwuchs in der zurückliegenden Saison erzielte, kann Julian Derstroff 14 Tore für sich verbuchen. Der 16-jährige Philipp Klement brachte sein Team elfmal zum Jubeln. Auch Malsam, Schmidt und Orban trugen mit jeweils vier Treffern entscheidend zum guten Abschneiden der U17 bei.