Mit viel Schwung starteten die jungen Roten Teufel in die Rückserie und feierten mit dem 1:0-Heimsieg gegen Fortuna Düsseldorf II einen Start nach Maß, worauf die Lautrer Amateure aufgrund der Witterungsbedingungen eine dreiwöchige Zwangspause zu überstehen hatte. Am Samstag, 18. Februar 2012, ging es dann bei der Zweiten Mannschaft des 1. FC Köln weiter, wo die Nachwuchskicker vom Betze durch den 14. Saisontreffer von Andrew Wooten mit 1:0 gewinnen konnten. Trotz Überlegenheit im Stadion „Rote Erde“ folgte dann allerdings die die erste Rückrundeniederlage gegen Borussia Dortmund II (1:2), bei der sich Keeper Marco Knaller schwer am Ellenbogen verletzte und bis Saisonende von Chris Keilmann ersetzt werden musste. Davon ließ sich die U23 aber nicht unterkriegen und legte drei Siege gegen Fortuna Köln (4:3 nach 1:2-Rückstand), den SV Elversberg (2:1) und TuS Koblenz (3:2) in Folge sowie ein torloses Remis im Duell mit dem SC Verl hin.
Gegen die Reserve von Borussia M´Gladbach folgte dann allerdings eine 2:3-Niederlage, wenngleich die jungen Roten Teufel sich ein klares Chancenplus erspielten, aber an ihrer Abschlussschwäche sowie naiven Fehlern in der Defensive scheiterten. Bedingt durch viele Umstellungen gaben die jungen Roten Teufel weitere Partie ungefährdet aus der Hand, wie besonders in den Heimspielen gegen Rot-Weiss Essen (1:2) und den Wuppertaler SV (2:4) deutlich wurde. Ganz anders der Auftritt in der Ferne, aus dem ein 2:0-Sieg beim VfL Bochum sowie ein Last-Minute-Punktgewinn (2:2) gegen Bayer 04 Leverkusen II zu Buche steht. Dem folgten drei Duelle, die Alois Schwartz im Nachhinein als „Ausbildungsspiele“ bezeichnete. Dabei unterlagen die Lautrer Amateure zunächst dem VfL Sportfreunde Lotte (0:1), worauf sich die FCKler auch im Rheinland-Pfalz-Derby gegen Eintracht Trier mit 1:3 geschlagen geben mussten. Gegen den SC Wiedenbrück (2:2) gelang dann endlich wieder ein Zähler.
„Wir wollten unseren Anspruch wahren und im letzten Auswärtsspiel einen Dreier einfahren. Unser Saisonziel war ein einstelliger Tabellenplatz, diesen haben wir mit dem heutigen Ergebnis erreicht“, erklärte Alois Schwartz nach Abpfiff der Partie gegen den SC Idar-Oberstein. Nach fünf vergeblichen Anläufen gegen fuhren die FCK-Amateure beim letzten Auswärtsspiel der Spielzeit in der Edelsteinstadt endlich wieder einen Dreier ein, worauf eine Nullnummer gegen Schalke II die Saison abschloss. Nach der Vizemeisterschaft in der Saison 2008/09, Position acht in der Spielzeit 2009/10 und dem vierten Rang in der vergangenen Saison sicherte sich die FCK-U23 damit erneut einen einstelligen Tabellenplatz. Eine Leistung, auf die jungen Roten Teufel mit Recht stolz sein können, gehörte die Mannschaft doch zu den jüngsten Teams der Regionalliga.
Zudem musste die Zweite Mannschaft des FCK zahlreiche Wechsel in der Startformation hinnehmen, da entweder Spieler aus dem Profikader bei den Amateuren aufliefen oder Jungtalente wie Torjäger Andrew Wooten (20 Tore in 24 Regionalligaspielen) in der Bundesliga ran durften. „Es gehört zu unserer Hauptaufgabe, Nachwuchsspieler an den Profikader heranzuführen. Das ist uns in dieser Saison mit Denis Linsmayer und Andrew Wooten gelungen, beide haben einen Profivertrag unterschrieben. Wir werden diese Linie auch in der kommenden Saison fortsetzen und nach dem „Weggang“ von Andrew zu den Profis einen neuen Torjäger suchen und weiter potentielle Lizenzspieler ausbilden“, so Schwartz, der auch 2012/13 wieder alles daran setzen wird, dass sich seine Schützlinge für den Lizenzspielerbereich der Roten Teufel empfehlen.