Aytekin pfeift seit 2004 als DFB-Schiedsrichter und ist seit 2006 in der 2. Liga aktiv. Hier stehen bisher 44 Spiele zu Buche. In der Bundesliga hat er aktuell schon 67 Spielen als Schiedsrichter vorgestanden und ist seit 2011 auch FIFA-Schiedsrichter.
Sein letztes FCK-Spiel fand im Februar auf dem Betzenberg gegen Dresden statt (3:0).
An den Seitenlinien unterstützen ihn Thorsten Schiffner und Michael Emmer. Vierter Offizieller ist Markus Wingenbach.