Aytekin ist seit 2004 DFB-Schiedsrichter und pfiff seit 2006 in der 2. Bundesliga 23 Spiele. Das letzte Spiel mit FCK-Beteiligung fand im Oktober 2009 im DFB-Pokal in Bremen statt (0:3).
Ihm stehen an den Seitenlinien Volker Wezel und Christian Erbs als Assistenten zur Verfügung. Walter Hofmann ist als vierter Offizieller vor Ort.